Za zgodą Instytucji Zarządzającej, Instytucja Pośrednicząca może powierzyć realizację części swoich zadań Instytucji Pośredniczącej II stopnia (Instytucje Wdrażające) lub innej instytucji, która posiada odpowiednie kompetencje, zasoby kadrowe oraz doświadczenie. Nie oznacza to jednak przeniesienia odpowiedzialności za realizację Programu (lub danej osi priorytetowej czy działania). Instytucja Pośrednicząca ponosi pełną odpowiedzialność za całość realizacji Programu.